药物是医疗的必备品。医生一旦诊断出某种疾患，必定要采取一定的治疗手段，用药治疗是最重要的选项，医与药总是联系在一起。华西医药甫一建立就是共同为四川的健康服务。在医学技术发展的同时，药学的发展，药物的开发和研究也随之兴盛。
年，加拿大英美会赫斐秋等一行八人到成都，经过近几个月的安顿后开设了教堂。同年11月3日，赫斐秋安排启尔德、史蒂文森在四圣祠北街教堂开办了一家小福音诊所。他们既是医生又是药师，用自己带来的药物为病人治病，由此开启了成都西医药治疗的历史。然而，由于语言的障碍，诊所开办不到三月就关闭，他们便集中学习中文。此后，启尔德被派到上海迎接加拿大教会派来的第二人员——文焕章、启希贤等。随后，启尔德、启希贤、文焕章等人被派医院。年，由赫斐秋征地、筹划，史医院在成都四圣祠北街12号建成。医院建立不久，就在年5月发生的教案中被捣毁，该院后来在年得到重建。但真正具有一定规模的，是由启尔德于年取得中、加两国资助购地，由余安主持修建的一所四医院。该医院于年正式开业，设有病床张。
医院不断扩大的同时，加拿大又派出了获得多伦多大学药学士、宾夕法尼亚大学药学博士学位的米玉士。他于年来华，先就职医院药房，后辗转至皖北赈灾。年他来到成都，在医院药房里工作。华西协合大学医科建立后，他又承担了药学的课程。
年，米玉士还招收了一名学完医科前期课程的学生，在对他进行了专门的药学培训后，医院工作。他虽不相信中医的理论，但却很认真的学习中医。米玉士对四川取之不竭的植物、动物和天然药物有着深刻的认识。他发现药材单子里有成百上千种的生药品种，却由于无法得到开发利用，只能当作原材料卖到西方，有的生药在加工后又被以高价进口回中国。他深感要利用这些药材制成各种药剂，为中国人民服务。于是，他向大学提出开办药学教育的建议：“开创华大药学系之举，意以为此直接造福人群”，但并未获得同意。
年，经加拿大英美会总部同意，医院开办了药学专修班，并参照加拿大安大略省的药学课程进行安排。年，专修班共有纪干晟、蒲谷邨两名学生毕业，其中纪干晟在大学留任教师。米玉士的妻子艾德娜在师徒三人的合影背后写下了一段留言：“米玉士和最近毕业的的两名药学学生，他们通过了毕业考试。其实，由于某种原因，虽然他们取消了一两门科目，但是他们的学习时间是够了的，而且很快会把这些科目补上的。我会把他们毕业情况说明发给你的，这也是我写给《华西教会新闻》、《志愿者公报》和其他媒体的内容。一旦这些被报导来，我就会把它发给你。”虽然药学专修班只办了一届，但这仍被视作是华西药学走向专业化教育的肇始。与此同时，英美会总部还批医院合作开办售药部，由售药部制医院，还可对外销售。医院的用药成本，医院和学校获利，展现了很好的前景。此时，他又再次提出在华大建立药学专业。年，由米玉士撰写的《药学基础》（FundamentalsofPharmacy）成为医学院通过C.M.A（中华医学会）出版发行的第一本专著。尽管如此，他为大学创建药学专业的建议于年再次被董事会否决，理由是“鉴于目前中国的形势及所存在的问题，现在要扩大学校的规模和人员是不现实的”。
在米玉士的不懈努力以及卓慧淑贤的夫人协助下，在大学终于度过20年代后期的动荡之后，创建药学专业的立案终成定局。年，从化学系转来三名学生，从医科又转来一名，组成了制药第一班，制药系正式建立。其宗旨是：“造就德，智、体优秀之中国学生，授以制药之专门知识和技术，并在华西区域建设及发展最新之制药事业，使有专门之基础，以服务社会。华西为生产药材最富之区域。该系之主要目的，在于预备制药人才，俾于毕业后，从事研究并制造医学上应用之药品，福利于人群。”制药系学制四年，学生需学习28门课程，其中专业课16门，学籍管理十分严格，毕业后授予药学理学士学位（DegreeofB.S.inPharm）。校方只给予开办费银元，常年经费银元，不足之处仍要米玉士自己筹措。教室、医院的一角。图书仪器募于国外，仅能供学生十人之用。尽管制药系在创建之初困难重重，但在米玉士的领导下还是很快发展起来。年，大学又对外招生12人，学生人数总计达到16人。年，仅有李兴隆、曾凤仪、杨惠裳、谭素云四名学生毕业，李、曾二人留校任助教。到年，教师就有冯大然、詹大经、启真道、高文明、冷乐施、彭子富、方瑞芝、德希德、纪干晟等12名。华西药学系虽然创建较晚，但在抗战时期得到大发展，发展至今已成为中国现代高等制药教育机构之一。
五大学时期，华西药学也和全校一同走入了大发展。一方面，战时五大联合办学，华西坝上云集了一批学者，药学领域的有齐大的薛愚、曹柏年、药理学家于光远等；同时，也因战时人才的流动，大学于年以中英庚款讲座教授之名聘请了山东大学理学院长、药物化学家汤腾汉到校任教授，米玉士不在时汤则代理系主任；此外，还聘了庚款研究员赵幼祥、郭质良、汪昭武等。加上本系毕业留校的优秀学生，师资队伍迅速扩大。年制药系扩大招生，注册学生达人，一举发展为理学院最大的系。在教学方面，制药系实行各校教师可兼聘，学生可以互选课程，相互承认学分的方法。在管理方面则成立了教学和训练部，参照欧美药学教育之标准，强化课程体系，增设了一些必要的专业课，加强实验操作课程；每位教授都要上相关的基础课和专业课，学生实行严格的淘汰制。这些管理方略，使得制药系在战时的教学质量仍得以保持在较高水平。
在科研方面也有新的进展。年成立药物研究部，先后由汤腾汉、汪昭武、陈思义主持，直到年。研究部的经费主要通过募集而来，第一笔来自庚款（中华文教促进基金会），解决了一些出任人员的工资；其次是英国宝威基（Well
